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金陵城的被拿下已经有二十天的时间，城内的一切也都归于平静，百姓们依旧过着和原先一般无二的日子。这二十天时间，马尾军陆军部队也陆续拿下了江宁府、苏州府以及松江府的各个县镇。曾养性所率领的陆军部队也和马尾海军这边一样，根本就没费什么功夫就拿下了苏州城，实际上，曾养性只是用了一天就拿下了苏州府。
苏州知府在看到马尾军大军开来的时候原本倒是也想坚守城池的，但是马尾军将喇布的脑袋竖起来送进城的时候，苏州城内的官员也就主动投降了。这仗还怎么打啊，大军九成九都被喇布带走，也都在喇布的指挥之下，现在连喇叭的人都都摆在面前了，就凭他们城内仅仅三千不到的兵马如何抵挡马尾军几万大军？
苏州府一下，其他的县城也就更简单了，苏州知府派人亲自跟随马尾军去各城劝降，每一个都是很顺利的献城投降。也就是大军进军到镇江府的时候再次受到了清军的抵挡，但是长江以南，参与的清军已经寥寥无几，完全不是马尾军的对手，都是轻易而下。从马尾军进入金陵城开始算起，马尾军也就是用了六天时间，便拿下了长江以南的所有江南省地盘。
后面这些天，马尾军并没有停留下来，而是继续北上，马尾军战舰倒是大部分还是停泊在长江之上但是却派遣了三十艘五级战舰沿着大运河北上，一路拿下了清廷上千艘漕运船只。估计就只这一条，清廷就该急眼了，没有了漕运与运往京城的粮食，清廷距离崩溃也就不再遥远。
在十三世纪末元朝定都北京后，为了使南北相连，不再绕道洛阳，必须开凿运河把粮食从南方运到北方。为此先后开凿了三段河道，把原来以洛阳为中心的隋代横向运河，修筑成以大都（背景）为中心，南下直达杭州的纵向大运河，元朝花了十年时间，先后开挖了“洛州河”和“会通河”，把天津至江苏清江之间的天然河道和湖泊连接起来，清江以南接邗沟和江南运河，直达杭州。而北京与天津之间，原有运河已废，又新修“通惠河”。这样，新的京杭大运河比绕道洛阳的隋唐大运河缩短了九百多公里。
元代开凿的重点段一是山东境内泗水至卫河段，一是大都至通州段。至元（元世祖忽必烈年号）十八年（公元一二八一年）开通了济州河，从任城（济宁）至须城（东平县）安山，长一百五十余里；至元二十六年又开通了会通河，从安山西南开渠，由寿张西北至临清，长两百五十多里；随后有陆续开通惠河，引京西昌平诸水入大都城，东出至通州入白河。直至十二年后元代大运河才全线通航，漕船可由杭州直达大都，成为今京杭运河的前身。
京杭大运河按地理位置分为七段：北京到通州区称通惠河，自昌平县白浮村神山泉经瓮山泊（今昆明湖）至积水潭、中南海，自文明门（今崇文门）外向东，在今天的朝阳区杨闸村向东南折，至通州高丽庄（今张家湾村）入潞河（今北运河故道），长一百六十多里；通州区到天津称北运河，长几近四百里；天津到临清称南运河，长八百里；临清到台儿庄称鲁运河，长约一千里；台儿庄到淮安称中运河，长两百里；淮安到瓜洲称里运河，长约三百六十里；镇江到杭州称江南运河，长约六百六十里。
明朝到现在的清廷一直都维持元运河的基础，前明时期还重新疏浚了元末已淤废的山东境内河段。京杭大运河作为南北的交通大动脉，历史上曾起过巨大作用，运河的通航，也极大的促进了沿岸城市的迅速发展。
据记载，漕运发达时期，从天津到通州的北运河上每年要承载两万艘运粮的漕船，官兵十二万人次，连同商船共三万艘。水道的开通使小小的直沽寨很快发展成了远近闻名的“天津卫”。北边的天津都达到了这样的规模，何况是起始位置的镇江、扬州一段？这地方更是繁华无比，尤其是扬州，虽然经过了清廷攻打江南时的一番屠杀，但是扬州城也早已恢复了元气，繁华程度比之金陵城有过之而无不及。
清廷也早已经得知了江南陷落的消息，清军的军队也在紧急调拨之中。原本最靠近的江北各府兵马根本不敢乱动，远一些的荆州一带的大军又不能分兵太多，而且路途又那么遥远，十天半个月大军根本无法抵达。但是在得知马尾军只是用了两天就拿下了金陵城，后续只五天时间就拿下了全部江北各府县之后，清军倒是不敢再轻易的快速进兵了，因此，得到消息有十几天了，清军增援的大队兵马还在千里之外。
经过这些天的梳理，马尾军已经将江南各府县稳定下来。耿精忠这次对这部地区也是下了狠手，这里乃是天下最繁华最富庶的区域，因此贪官污吏多不胜数，各种豪门世家把持地方，土地兼并也是最为严重。传承悠久的世家基本上名声都不错，虽然几十年前主动投靠了清廷，但是也是明哲保身。但是新起的有十来个大世家，原先只能算是小世家或者就只是个普通地主的，在当年清军攻打江南的时候充当了极其不好的角色，后来迅速发展成为不逊色于几百年世家的大家族。这些家族，能够如此之快的发展，那也是侵占了不知道多少人家的财产，掠夺了不知道多少的资源，对于这些家族，耿精忠可是没有仁慈，一律抄家斩首。
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